Да, атом имеет тень и не только атом, но и атомное ядро и даже нуклоны в ядре. Тени по определению зависят от того, каким образом и чем освещается объект. Очевидно, в тёмной комнате теней нет. В том случае, если осветить объект потоком нейтрино, то даже человек не оставит тени, а для нейтрино малых энергий и планета земля останется без тени. Тени (размеры) у ядер и нуклонов могут быть "Электромагнитные" и "ядерные", в зависимости от типа частиц в потоке "освещения".
