Водород входит в состав самого распространенного вещества на земле - воды (11, 19% водорода по массе), в состав соединений, слагающих угли, нефть, природные газы, глины, а также организмы животных и растений (то есть в состав белков, нуклеиновых кислот, жиров, углеводов и других.

На его долю приходится 88% всех атомов.