Биологи придумали, как направить эволюцию вирусов в тупик.
Исследователи гарвардского университета предложили не просто следить за опасными мутациями вирусов, а заранее делать их появление невыгодным. Работа в журнале Pnas опубликована.
Метод назвали "Проектированием Ландшафта Приспособленности". Обычно эволюцию вируса представляют как путь к вариантам, которые лучше размножаются и распространяются. Авторы предлагают изменить условия с помощью сочетаний антител так, чтобы вероятные пути к опасным мутациям вели не к успеху, а к ослаблению вируса
.
Команда создала модель, которая учитывает взаимодействие вирусного белка с рецепторами клеток и антителами, а также влияние мутаций на заражение и распространение. Ее сначала проверили на мышином норовирусе: прогнозы совпали с результатами лабораторных экспериментов. Затем подход применили к данным по Sars - CoV - 2 и его спайковому белку.
В компьютерном моделировании некоторые "Коктейли" антител превращали обычные пути ухода вируса от иммунной защиты в эволюционные тупики. Мутации могли возникать, но развиваться дальше такому варианту становилось невыгодно.
По словам руководителя работы Юджина шахновича, следующий шаг - проверить эти комбинации в реальных экспериментах. Авторы также допускают, что принцип пригодится в иммунотерапии рака и создании полезных белков.
Изображение: Vectorfusionart /Shutterstock/Fotodom.